Imagerie en agronomie et en agro-alimentaire

DURÉE
• 21H

PUBLIC
• CHERCHEURS, INGÉNIEURS, TECHNICIENS DE LABORATOIRE, INDUSTRIELS, ÉTUDIANTS

MODALITÉ
• FORMATION EN PRÉSENTIEL

Les fondamentaux en acquisition et analyse d'images pour l'agronomie et l'agroalimentaire

Au cœur de l'observation t de la mesure, l'imagerie joue un rôle essentiel. En amont du traitement des données, la qualité de l'acquisition des images conditionne absolument la bonne exploitation des informations récoltées.

La maîtrise des fondamentaux en physique (particulièrement en optique) et en analyse d'images est donc un préalable à toute bonne pratique dans le domaine. L'agronomie et l'agroalimentaire n'échappent pas à la règle, que ce soit pour traiter du contrôle qualité ou du phénotypage des plantes.

Objectifs

À l'issue de cette formation, les stagiaires seront en mesure de :

Optimiser leur pratique d’acquisition d’images
Exploiter efficacement les capacités des appareils d’acquisition d’images
Identifier les éléments nécessaires à une bonne acquisition en fonction de leurs applications
Utiliser un logiciel d’acquisition et de traitement d’image

Public souhaitant améliorer sa pratique par une meilleure connaissance des principes physiques et une meilleure exploitation des équipements technologiques qui conditionnent l’optimisation de l’acquisition d’images : chercheurs, ingénieurs, techniciens de laboratoire (département R&D, centre de recherche, institut technique), industriels, étudiants.

Effectif : 12 stagiaires

Aucun prérequis.

Jour 1

Bases des principes physiques pour l’acquisition des images et exemples de traitements basiques :
- Qu’est-ce qu’une image (résolution, réglages optiques, éclairage, bruit…)
- Les notions de base (luminance, contraste, couleur, acuité, uniformité…)
- La calibration des caméras
- Les opérateurs de traitement d’images, les filtres…
Applications au phénotypage + autres exemples
Manipulation de caméras
Tests d’acquisition dans différentes conditions d’illumination
Visite de la 4PMI
Visite de la Plateforme DImaCell

Jour 2

Les différents types d’imagerie (anatomique, fonctionnelle, fluorescence, thermique…) et leur utilisation en fonction de leur application potentielle
Présentation des projets individuels
Prise en main logiciel (ImageJ, Matlab…)
Traitement haut-niveau et bas-niveau des images
Mise à l’épreuve des connaissances théoriques (séance 1) : Travail en binôme à partir du matériau apporté par les stagiaires.

Jour 3

Mise à l’épreuve des connaissances théoriques (séance 2) : Travail en binôme à partir du matériau apporté par les stagiaires.
Mise à l’épreuve des connaissances théoriques (séance 3) : Restitution au groupe du travail réalisé en binôme.

Le parcours de formation combine des apports théoriques et leur mise en pratique via :

Accès à une plateforme en ligne (ressources pédagogiques, suivi de projet…).
Salle informatique équipée de caméras et d’ordinateurs
Utilisation de logiciels spécialisés dans l’acquisition et le traitement d’images
Exploitation des études de cas à partir de l’analyse du matériau proposé par chaque participant
Visite de la Plateforme de Phénotypage Haut Débit (INRAe - L'Institut Agro Dijon - UBFC) et de la Plateforme DImaCell

Les + de la formation

Cette formation complète allant de l'acquisition (essentielle) aux traitements bénéficiera des matériels de la plateforme d'imagerie (possiblement Atelier du Faire à L'Institut Agro Dijon) listés ci-dessous :
Caméras thermiques, rapides, noir et blanc, couleur, multispectrales, microscopes, associées à différents objectifs
Scanner 3D associé à une imprimante 3D
Banc didactique de simulation de ligne de production pour tester le couplage capteurs d'images / systèmes automatisés

A l’issue du parcours les stagiaires évaluent la formation via un questionnaire en ligne.
Une attestation individuelle de suivi de formation est délivrée à l’issue du parcours.

L'Institut Agro Dijon
26 Boulevard du Docteur Petitjean
21079 DIJON

1270€

Frédéric CONTAULT
Maître de conférences HDR à l'Institut Agro Dijon

David ROUSSEAU
Professeur à l'Université d'Angers (Intervenant extérieur)

Avec la participation envisagée de Pascale WINCKLER (DImaCell), Mickaël LAMBOEUF (4PMI, INRAE), Julien DUBOIS et Hermine CHATOUX (Université de Bourgogne)

Industriels utilisant l'imagerie dans leurs entreprises